台湾基督教会2003年教势报告调查统计，长老教会虽然在会友与会堂数高居各宗派之冠，但是这项数字若与2000年相较，信徒总数却减少近7,400人，年增率为负百分之1.66，其中原住民教会人数急遽减少，让牧者忧心不已。
基督教资料中心调查报告指出，台湾基督长老教会2003年会友总人数217,280人，主日出席102,990人；全台堂会1,218间，无论人数或堂会都领先各宗派。
然而长老教会内部统计分析，却进一步发现多项未来待努力的事奉要务。例如检视长老教会平地12个中区会，虽然有9个中会出现成长，但是却集中在新竹以北地区，以新竹中会为例，年增率百分之5.75为最高，且连续多年成长，相形之下，南部地区则不进反退，以高雄寿山中会为例，年增率为负百分之4.73。
在原住民15个中会之中，只有2个中会成长，其余都呈减少趋势，与二年前相较流失10,780人，与平地中会相比，明显呈现对比。长老教会原住民宣道委员会认为，随着社会变迁与都市发展，原住民纷纷向平地都市迁移，致山区人口逐年递减，信徒聚会人数自然也受到影响。
因此对长老教会而言，今后如何关怀到平地谋生就业与求学的原住民，是平地教会与山地教会应加强连系与搭配的课题。
依据基督教资料中心统计，2003年全台仍有高雄县三民乡、屏东县雾台乡、玛家乡、狮子乡、花莲县卓溪乡等五个山地乡，原住民基督徒人数，居全乡的总人口数比例五成以上。
