台灣基督教會2003年教勢報告調查統計，長老教會雖然在會友與會堂數高居各宗派之冠，但是這項數字若與2000年相較，信徒總數卻減少近7,400人，年增率為負百分之1.66，其中原住民教會人數急遽減少，讓牧者憂心不已。
基督教資料中心調查報告指出，台灣基督長老教會2003年會友總人數217,280人，主日出席102,990人；全台堂會1,218間，無論人數或堂會都領先各宗派。
然而長老教會內部統計分析，卻進一步發現多項未來待努力的事奉要務。例如檢視長老教會平地12個中區會，雖然有9個中會出現成長，但是卻集中在新竹以北地區，以新竹中會為例，年增率百分之5.75為最高，且連續多年成長，相形之下，南部地區則不進反退，以高雄壽山中會為例，年增率為負百分之4.73。
在原住民15個中會之中，只有2個中會成長，其餘都呈減少趨勢，與二年前相較流失10,780人，與平地中會相比，明顯呈現對比。長老教會原住民宣道委員會認為，隨著社會變遷與都市發展，原住民紛紛向平地都市遷移，致山區人口逐年遞減，信徒聚會人數自然也受到影響。
因此對長老教會而言，今後如何關懷到平地謀生就業與求學的原住民，是平地教會與山地教會應加強連繫與搭配的課題。
依據基督教資料中心統計，2003年全台仍有高雄縣三民鄉、屏東縣霧台鄉、瑪家鄉、獅子鄉、花蓮縣卓溪鄉等五個山地鄉，原住民基督徒人數，居全鄉的總人口數比例五成以上。
