立法会通过“校本条例”，反对条例的宗教团体毫不退让，教会和政府在教育的长年合作关系，正面临严峻的考验。教会是恐怕校董会变成法团后，教会不再是负责人，新加入校董会的人，不一定认同教会的办学理念，新旧校董之间会意见相左，教会办学理想会不受尊重。
教会办学的理想除了是教育外，也是要宣扬基督信仰，所以教会学校有圣经学科，甚至布道聚会。如果新加入的校董不是信仰基督的，有可能经由“民主程序”使学校的宗教色彩褪色。在过去百年以降，教会学校不只造就千万学子，也带领了不少学生信主，孙中山先生就是很好的例子。这方面的成就不容置疑，只是尚嫌不够。
有话说，儿童是社会明日的主人翁，今天谁能赢取儿童，谁就决定社会将来的气氛。教会在香港办学已有百年历史，除天主教外，现今由基督教会办的大专、中小学及幼稚园，已有三百五十多间，以这样的历史和规模，足以使香港基督教化好几十年了，但现实告诉我们，基督教文化并非香港的主流文化，香港的基督徒人口多年来仍徘徊在百分之三左右。究竟教会学校出了甚帧绦题？
这个问题需要教会深思和检讨。是否有教育使命却无文化使命？是否只传授圣经知识却不去布道？是否单凭头脑理性却忽略圣灵大能？有一位在教会学校长大的弟兄说︰“我决志不是在学校，而是在葛培理布道会。”教会学校的教育成效是有目共睹的，但福音成效怎样呢？虽然不是交白卷，但从社会的气氛看，仍是差强人意。
“校本条例”既然通过了，教会学校除了反省之外，也要思想如何因应。与其看“校本条例”是一个阻，不如看为一个机遇，让教会趁机重新调整布道策略，布道对像要从学生身上，延伸至家长和校友，更积极向他们传福音，使派来的校董也成为基督徒。若不信主的校董真的阻监学校体制内的福音工作，也不要看为灾难，因为福音工作也可以在体制以外进行，可能更有效。若有压力临到，学校内的基督徒群体可能会更趋成熟，更有生命力。但愿教会懂得借力使力，从这些改变中抓住神给教会的契机，开创新局面。
